RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394595.7

PITX2-204, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PITX2, Length 1,693 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-204ENST00000394595 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.64■■■■□ 3.62
PITX2-204ENST00000394595 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.2■■■□□ 2.91
PITX2-204ENST00000394595 ABCC9O60706 1549 aa31.99■■■□□ 2.71
PITX2-204ENST00000394595 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
PITX2-204ENST00000394595 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.27■■■□□ 2.6
PITX2-204ENST00000394595 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.18■■■□□ 2.58
PITX2-204ENST00000394595 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.13■■■□□ 2.57
PITX2-204ENST00000394595 NACADO15069 1562 aa31.12■■■□□ 2.57
PITX2-204ENST00000394595 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.01■■■□□ 2.55
PITX2-204ENST00000394595 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX2-204ENST00000394595 SCRIBQ14160 1630 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX2-204ENST00000394595 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.06■■■□□ 2.4
PITX2-204ENST00000394595 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.03■■■□□ 2.4
PITX2-204ENST00000394595 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
PITX2-204ENST00000394595 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.27■■■□□ 2.28
PITX2-204ENST00000394595 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PITX2-204ENST00000394595 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PITX2-204ENST00000394595 SMARCA4P51532 1647 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX2-204ENST00000394595 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.01■■■□□ 2.23
PITX2-204ENST00000394595 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.97■■■□□ 2.23
PITX2-204ENST00000394595 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX2-204ENST00000394595 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PITX2-204ENST00000394595 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.81■■■□□ 2.2
PITX2-204ENST00000394595 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.81■■■□□ 2.2
PITX2-204ENST00000394595 SMARCA2P51531 1590 aa28.78■■■□□ 2.2
PITX2-204ENST00000394595 NCAPD3P42695 1498 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX2-204ENST00000394595 WIZO95785 1651 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX2-204ENST00000394595 HMGXB3Q12766 1538 aa28.59■■■□□ 2.17
PITX2-204ENST00000394595 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PITX2-204ENST00000394595 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PITX2-204ENST00000394595 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PITX2-204ENST00000394595 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.14■■■□□ 2.09
PITX2-204ENST00000394595 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.92■■■□□ 2.06
PITX2-204ENST00000394595 CFTRP13569 1480 aa27.86■■■□□ 2.05
PITX2-204ENST00000394595 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.86■■■□□ 2.05
PITX2-204ENST00000394595 NESP48681 1621 aa27.85■■■□□ 2.05
PITX2-204ENST00000394595 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX2-204ENST00000394595 PRDM2Q13029 1718 aa27.66■■■□□ 2.02
PITX2-204ENST00000394595 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.57■■■□□ 2
PITX2-204ENST00000394595 ERCC6Q03468 1493 aa27.52■■■□□ 2
PITX2-204ENST00000394595 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.52■■■□□ 2
PITX2-204ENST00000394595 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX2-204ENST00000394595 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.32■■□□□ 1.96
PITX2-204ENST00000394595 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PITX2-204ENST00000394595 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
PITX2-204ENST00000394595 ABCC8Q09428 1581 aa27.24■■□□□ 1.95
PITX2-204ENST00000394595 WDR62O43379 1518 aa27.21■■□□□ 1.95
PITX2-204ENST00000394595 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
PITX2-204ENST00000394595 TOPBP1Q92547 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
PITX2-204ENST00000394595 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.19■■□□□ 1.94
PITX2-204ENST00000394595 CUX1P39880 1505 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX2-204ENST00000394595 TOP2BQ02880 1626 aa27.09■■□□□ 1.93
PITX2-204ENST00000394595 SYNJ1O43426 1573 aa27.09■■□□□ 1.93
PITX2-204ENST00000394595 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.07■■□□□ 1.92
PITX2-204ENST00000394595 CUX2O14529 1486 aa27.06■■□□□ 1.92
PITX2-204ENST00000394595 CHIC1Q5VXU3 224 aa27■■□□□ 1.91
PITX2-204ENST00000394595 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27■■□□□ 1.91
PITX2-204ENST00000394595 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PITX2-204ENST00000394595 TRIM41Q8WV44 630 aa26.97■■□□□ 1.91
PITX2-204ENST00000394595 SOGA1O94964 1423 aa26.92■■□□□ 1.9
PITX2-204ENST00000394595 IFT140Q96RY7 1462 aa26.89■■□□□ 1.89
PITX2-204ENST00000394595 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX2-204ENST00000394595 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PITX2-204ENST00000394595 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX2-204ENST00000394595 WDR97A6NE52 1622 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX2-204ENST00000394595 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PITX2-204ENST00000394595 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PITX2-204ENST00000394595 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
PITX2-204ENST00000394595 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PITX2-204ENST00000394595 KIF27Q86VH2 1401 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX2-204ENST00000394595 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX2-204ENST00000394595 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX2-204ENST00000394595 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX2-204ENST00000394595 GRIN2BQ13224 1484 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX2-204ENST00000394595 IGF1RP08069 1367 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX2-204ENST00000394595 PBRM1Q86U86 1689 aa26.47■■□□□ 1.83
PITX2-204ENST00000394595 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.47■■□□□ 1.83
PITX2-204ENST00000394595 EEA1Q15075 1411 aa26.45■■□□□ 1.83
PITX2-204ENST00000394595 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PITX2-204ENST00000394595 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.39■■□□□ 1.81
PITX2-204ENST00000394595 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX2-204ENST00000394595 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX2-204ENST00000394595 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX2-204ENST00000394595 CUL7Q14999 1698 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX2-204ENST00000394595 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX2-204ENST00000394595 ADAMTS12P58397 1594 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX2-204ENST00000394595 SYNJ2O15056 1496 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX2-204ENST00000394595 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PITX2-204ENST00000394595 PRXQ9BXM0 1461 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX2-204ENST00000394595 FBLN2P98095 1184 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX2-204ENST00000394595 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX2-204ENST00000394595 CHD1O14646 1710 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX2-204ENST00000394595 GRIN2AQ12879 1464 aa26.17■■□□□ 1.78
PITX2-204ENST00000394595 KIF21BO75037 1637 aa26.11■■□□□ 1.77
PITX2-204ENST00000394595 OSCARQ8IYS5 282 aa26.1■■□□□ 1.77
PITX2-204ENST00000394595 NUP160Q12769 1436 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX2-204ENST00000394595 CEP170Q5SW79 1584 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX2-204ENST00000394595 GOLGA3Q08378 1498 aa26■■□□□ 1.75
PITX2-204ENST00000394595 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.96■■□□□ 1.75
PITX2-204ENST00000394595 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.3 ms