Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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