Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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SYT17Q9BSW7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SYT17Q9BSW7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT17Q9BSW7 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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