Protein–RNA interactions for Protein: O95340

PAPSS2, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS2O95340 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPSS2O95340 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms