Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms