Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPF2Q9H7B2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms