Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX11Q96FC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX11Q96FC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX11Q96FC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms