Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP4F3Q08477 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms