Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB4P54760 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms