Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXN2P32314 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN2P32314 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms