Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAMK4Q16566 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms