Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms