Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms