Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-12■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.081e-12■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 RPRD1A-204ENST00000585953 2357 ntTSL 32.82□□□□□ -1.961e-12■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 RPRD1A-210ENST00000591994 2484 ntTSL 22.73□□□□□ -1.971e-12■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 CLUHP3-203ENST00000431761 723 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-7■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 PUM1-218ENST00000526215 586 ntTSL 26.5□□□□□ -1.371e-14■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.033e-7■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 318.83■□□□□ 0.63e-7■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 UBE2Z-204ENST00000506498 766 ntTSL 49□□□□□ -0.973e-7■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 UBE2Z-202ENST00000504684 598 ntTSL 46.78□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 UBE2Z-206ENST00000511373 769 ntTSL 24.22□□□□□ -1.733e-7■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.031e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.231e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-210ENST00000565966 798 ntTSL 512.6□□□□□ -0.391e-8■■□□□ 12.2
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SF3A3Q12874 HERPUD1-206ENST00000563343 567 ntTSL 45.87□□□□□ -1.471e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 HERPUD1-217ENST00000569429 562 ntTSL 44.86□□□□□ -1.631e-8■■□□□ 12.2
SF3A3Q12874 C16orf70-203ENST00000563853 1025 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 AGFG2-204ENST00000474713 1864 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 GMPPA-208ENST00000455657 907 ntTSL 515.55■□□□□ 0.085e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 GMPPA-210ENST00000480506 835 ntTSL 511.16□□□□□ -0.625e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 GMPPA-214ENST00000635609 569 ntTSL 510.05□□□□□ -0.85e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-202ENST00000444874 2661 ntTSL 215.24■□□□□ 0.037e-10■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.387e-10■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 516.97■□□□□ 0.313e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 516.26■□□□□ 0.193e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 313.47□□□□□ -0.253e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 29.62□□□□□ -0.873e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)5.25□□□□□ -1.573e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.593e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 34.61□□□□□ -1.673e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-207ENST00000472373 1182 ntTSL 24.6□□□□□ -1.673e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 23.3□□□□□ -1.883e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.893e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 33.15□□□□□ -1.913e-18■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.79□□□□□ -1.963e-18■■□□□ 12.1
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SF3A3Q12874 PTBP1-218ENST00000592804 742 ntTSL 217.72■□□□□ 0.431e-9■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 WDR73-215ENST00000560182 542 ntTSL 419.54■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 WDR73-203ENST00000558019 528 ntTSL 48.44□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-17■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 MAP4K4-218ENST00000498066 1017 ntTSL 210.45□□□□□ -0.741e-32■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 318.25■□□□□ 0.515e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 517.48■□□□□ 0.395e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 517.43■□□□□ 0.385e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 517.28■□□□□ 0.365e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-207ENST00000581509 426 ntTSL 217.23■□□□□ 0.355e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.245e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.095e-6■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 510.62□□□□□ -0.715e-6■■□□□ 12.1
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SF3A3Q12874 TBC1D8-206ENST00000481317 573 ntTSL 49.18□□□□□ -0.947e-7■■□□□ 12.1
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SF3A3Q12874 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.25e-8■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.255e-8■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 P3H1-206ENST00000447502 453 ntTSL 39.31□□□□□ -0.922e-19■■□□□ 12.1
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SF3A3Q12874 FGFR1-223ENST00000496296 1898 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.055e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DHRS1-210ENST00000561273 2027 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.085e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DHRS1-204ENST00000558340 1623 ntTSL 513.82□□□□□ -0.21e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-221ENST00000484370 826 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.375e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DHRS1-206ENST00000559088 719 ntTSL 312.73□□□□□ -0.371e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DHRS1-209ENST00000561137 2660 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-237ENST00000532386 725 ntTSL 312□□□□□ -0.495e-15■■□□□ 12.1
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SF3A3Q12874 FGFR1-218ENST00000474970 764 ntTSL 511.85□□□□□ -0.515e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-231ENST00000527203 556 ntTSL 39.86□□□□□ -0.835e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-229ENST00000526742 657 ntTSL 49.65□□□□□ -0.865e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 ABCA1-204ENST00000494467 807 ntTSL 38.73□□□□□ -1.015e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-234ENST00000530568 467 ntTSL 38.62□□□□□ -1.035e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 37.98□□□□□ -1.135e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-233ENST00000529552 688 ntTSL 47.57□□□□□ -1.25e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-240ENST00000533668 571 ntTSL 56.83□□□□□ -1.325e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)2.33□□□□□ -2.045e-15■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 PABPN1-206ENST00000556809 969 ntTSL 220.67■□□□□ 0.92e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)19.01■□□□□ 0.638e-8■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 313.2□□□□□ -0.31e-16■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 321.94■■□□□ 1.16e-11■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-213ENST00000528377 898 ntTSL 219.74■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-227ENST00000534139 626 ntTSL 319.62■□□□□ 0.734e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-211ENST00000528314 559 ntTSL 219.07■□□□□ 0.644e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-217ENST00000530014 766 ntTSL 518.42■□□□□ 0.544e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-225ENST00000533075 582 ntTSL 318.38■□□□□ 0.534e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-205ENST00000525086 575 ntTSL 418.01■□□□□ 0.474e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-218ENST00000530103 544 ntTSL 518.01■□□□□ 0.474e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.374e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-221ENST00000532244 786 ntTSL 217.36■□□□□ 0.374e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-219ENST00000530638 582 ntTSL 516.35■□□□□ 0.214e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.094e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.034e-7■■□□□ 12.1
SF3A3Q12874 NDUFV1-203ENST00000524838 1200 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 04e-7■■□□□ 12.1
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