Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01547P58512 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms