Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMPD1P23109 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms