Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LDLRP01130 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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