Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLGNO14967 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms