Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SAMD8Q96LT4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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