Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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