Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIP10Q15642 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIP10Q15642 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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