Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIP10Q15642 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIP10Q15642 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIP10Q15642 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIP10Q15642 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRIP10Q15642 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIP10Q15642 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIP10Q15642 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIP10Q15642 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIP10Q15642 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIP10Q15642 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIP10Q15642 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIP10Q15642 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIP10Q15642 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIP10Q15642 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIP10Q15642 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIP10Q15642 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIP10Q15642 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIP10Q15642 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIP10Q15642 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIP10Q15642 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIP10Q15642 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIP10Q15642 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIP10Q15642 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIP10Q15642 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIP10Q15642 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIP10Q15642 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP10Q15642 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP10Q15642 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIP10Q15642 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIP10Q15642 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRIP10Q15642 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIP10Q15642 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIP10Q15642 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIP10Q15642 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIP10Q15642 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIP10Q15642 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIP10Q15642 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIP10Q15642 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIP10Q15642 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIP10Q15642 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIP10Q15642 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIP10Q15642 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIP10Q15642 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIP10Q15642 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIP10Q15642 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIP10Q15642 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIP10Q15642 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIP10Q15642 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIP10Q15642 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIP10Q15642 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP10Q15642 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP10Q15642 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP10Q15642 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIP10Q15642 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIP10Q15642 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP10Q15642 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIP10Q15642 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP10Q15642 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIP10Q15642 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP10Q15642 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP10Q15642 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIP10Q15642 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP10Q15642 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP10Q15642 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP10Q15642 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP10Q15642 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP10Q15642 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIP10Q15642 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIP10Q15642 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIP10Q15642 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP10Q15642 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIP10Q15642 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIP10Q15642 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP10Q15642 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP10Q15642 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIP10Q15642 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIP10Q15642 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP10Q15642 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP10Q15642 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP10Q15642 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP10Q15642 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP10Q15642 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIP10Q15642 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP10Q15642 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP10Q15642 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP10Q15642 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIP10Q15642 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP10Q15642 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP10Q15642 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP10Q15642 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIP10Q15642 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP10Q15642 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.6 ms