Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX2A2RU54 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX2A2RU54 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms