Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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