Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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