Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms