Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms