Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSRP3P50461 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms