RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441418.2

KCNQ1DN-201, Transcript of KCNQ1 downstream neighbor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1DN, Length 1,093 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DN-201ENST00000441418 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.9■■■■□ 3.5
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.29■■■□□ 2.12
KCNQ1DN-201ENST00000441418 NCAPD3P42695 1498 aa28.28■■■□□ 2.12
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 NESP48681 1621 aa27.36■■□□□ 1.97
KCNQ1DN-201ENST00000441418 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.32■■□□□ 1.96
KCNQ1DN-201ENST00000441418 ERCC6Q03468 1493 aa27.2■■□□□ 1.95
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1DN-201ENST00000441418 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1DN-201ENST00000441418 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.93■■□□□ 1.9
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 ABCC8Q09428 1581 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CUX2O14529 1486 aa26.83■■□□□ 1.89
KCNQ1DN-201ENST00000441418 WDR62O43379 1518 aa26.82■■□□□ 1.88
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 TOPBP1Q92547 1522 aa26.71■■□□□ 1.87
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 CUX1P39880 1505 aa26.62■■□□□ 1.85
KCNQ1DN-201ENST00000441418 TOP2BQ02880 1626 aa26.53■■□□□ 1.84
KCNQ1DN-201ENST00000441418 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
KCNQ1DN-201ENST00000441418 IFT140Q96RY7 1462 aa26.5■■□□□ 1.83
KCNQ1DN-201ENST00000441418 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
KCNQ1DN-201ENST00000441418 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.49■■□□□ 1.83
KCNQ1DN-201ENST00000441418 SYNJ1O43426 1573 aa26.46■■□□□ 1.83
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.35■■□□□ 1.81
KCNQ1DN-201ENST00000441418 TRIM41Q8WV44 630 aa26.32■■□□□ 1.8
KCNQ1DN-201ENST00000441418 WDR97A6NE52 1622 aa26.3■■□□□ 1.8
KCNQ1DN-201ENST00000441418 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.29■■□□□ 1.8
KCNQ1DN-201ENST00000441418 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
KCNQ1DN-201ENST00000441418 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
KCNQ1DN-201ENST00000441418 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.18■■□□□ 1.78
KCNQ1DN-201ENST00000441418 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
KCNQ1DN-201ENST00000441418 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.15■■□□□ 1.78
KCNQ1DN-201ENST00000441418 GRIN2BQ13224 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
KCNQ1DN-201ENST00000441418 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.1■■□□□ 1.77
KCNQ1DN-201ENST00000441418 KIF27Q86VH2 1401 aa26.09■■□□□ 1.77
KCNQ1DN-201ENST00000441418 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.01■■□□□ 1.75
KCNQ1DN-201ENST00000441418 PBRM1Q86U86 1689 aa26■■□□□ 1.75
KCNQ1DN-201ENST00000441418 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
KCNQ1DN-201ENST00000441418 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1DN-201ENST00000441418 IGF1RP08069 1367 aa25.93■■□□□ 1.74
KCNQ1DN-201ENST00000441418 EEA1Q15075 1411 aa25.89■■□□□ 1.74
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
KCNQ1DN-201ENST00000441418 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNQ1DN-201ENST00000441418 SYNJ2O15056 1496 aa25.87■■□□□ 1.73
KCNQ1DN-201ENST00000441418 FBLN2P98095 1184 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNQ1DN-201ENST00000441418 OSCARQ8IYS5 282 aa25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1DN-201ENST00000441418 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.83■■□□□ 1.73
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KCNQ1DN-201ENST00000441418 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.78■■□□□ 1.72
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CHD1O14646 1710 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNQ1DN-201ENST00000441418 GRIN2AQ12879 1464 aa25.73■■□□□ 1.71
KCNQ1DN-201ENST00000441418 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.67■■□□□ 1.7
KCNQ1DN-201ENST00000441418 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
KCNQ1DN-201ENST00000441418 PRXQ9BXM0 1461 aa25.65■■□□□ 1.7
KCNQ1DN-201ENST00000441418 NUP160Q12769 1436 aa25.62■■□□□ 1.69
KCNQ1DN-201ENST00000441418 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.59■■□□□ 1.69
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CEP170Q5SW79 1584 aa25.53■■□□□ 1.68
KCNQ1DN-201ENST00000441418 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.53■■□□□ 1.68
KCNQ1DN-201ENST00000441418 KIF21BO75037 1637 aa25.5■■□□□ 1.67
KCNQ1DN-201ENST00000441418 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.5■■□□□ 1.67
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