Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF4Q9NR80 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF4Q9NR80 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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