Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB7Q99436 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMB7Q99436 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMB7Q99436 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB7Q99436 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms