Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFRF1Q6IPR1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETFRF1Q6IPR1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms