Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39AQ14964 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB39AQ14964 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB39AQ14964 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB39AQ14964 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39AQ14964 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39AQ14964 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB39AQ14964 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB39AQ14964 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB39AQ14964 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39AQ14964 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39AQ14964 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms