Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms