Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 ZC3H15-205ENST00000468120 601 ntTSL 45.42□□□□□ -1.544e-8■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 ZC3H15-207ENST00000481101 558 ntTSL 43.62□□□□□ -1.834e-8■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.424e-7■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.034e-7■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 21.6
TRA2AQ13595 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.98□□□□□ -1.932e-7■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.894e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 220■□□□□ 0.794e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-213ENST00000566636 863 ntTSL 319.49■□□□□ 0.714e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 318.31■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-216ENST00000568709 809 ntTSL 518.22■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-208ENST00000563785 888 ntTSL 218.07■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 516.49■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-206ENST00000563170 904 ntTSL 316.14■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 MVD-215ENST00000568133 853 ntTSL 316.12■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 NCBP3-207ENST00000577169 645 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 GTPBP2-209ENST00000480263 898 ntTSL 213.67□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 GTPBP2-205ENST00000442748 946 ntTSL 313.41□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 GTPBP2-208ENST00000476510 2816 ntTSL 510□□□□□ -0.814e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-12■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 LYAR-202ENST00000452476 1468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 SMARCA5-202ENST00000508573 363 ntTSL 24.48□□□□□ -1.693e-12■■■■□ 21.5
TRA2AQ13595 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.471e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.351e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 NSMCE4A-211ENST00000489266 2399 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.61e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.271e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 G3BP1-212ENST00000522761 1763 ntTSL 216.39■□□□□ 0.211e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-203ENST00000372121 848 ntTSL 516.03■□□□□ 0.161e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-206ENST00000420568 1256 ntTSL 516.03■□□□□ 0.161e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.151e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-209ENST00000468915 1597 ntTSL 514.19□□□□□ -0.141e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 G3BP1-208ENST00000520177 2700 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.431e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 512.06□□□□□ -0.481e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 512.05□□□□□ -0.481e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 512.02□□□□□ -0.491e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.641e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-209ENST00000478274 969 ntTSL 210.58□□□□□ -0.721e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.45□□□□□ -0.741e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 210.36□□□□□ -0.751e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 310.22□□□□□ -0.771e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 39.35□□□□□ -0.911e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 NSMCE4A-206ENST00000468209 1041 ntTSL 38.9□□□□□ -0.981e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.041e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.171e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-221ENST00000489032 561 ntTSL 37.71□□□□□ -1.181e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.72□□□□□ -1.331e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.431e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SLC13A3-207ENST00000450298 707 ntTSL 36.04□□□□□ -1.441e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 35.89□□□□□ -1.471e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.471e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRAPPC12-208ENST00000437733 518 ntTSL 55.86□□□□□ -1.471e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 GAS5-217ENST00000444470 424 ntTSL 25.45□□□□□ -1.541e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 25.45□□□□□ -1.541e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.591e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 WDR12-207ENST00000477727 362 ntTSL 34.48□□□□□ -1.691e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.711e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.711e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-216ENST00000533119 742 ntTSL 54.25□□□□□ -1.731e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-211ENST00000484100 671 ntTSL 24.25□□□□□ -1.731e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.731e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 WDR12-205ENST00000475611 478 ntTSL 33.92□□□□□ -1.781e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TMCO3-206ENST00000473287 459 ntTSL 23.33□□□□□ -1.881e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.911e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 NSMCE4A-210ENST00000483541 694 ntTSL 32.97□□□□□ -1.931e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.991e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 21.77□□□□□ -2.131e-5■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 LINC01146-204ENST00000556033 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-209ENST00000502749 790 ntTSL 519.03■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-216ENST00000510483 719 ntTSL 418.98■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ATG3-208ENST00000495756 1455 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TCHP-206ENST00000544838 2077 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-7■■■■□ 21.3
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 93.2 ms