RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495756.5

ATG3-208, Transcript of autophagy related 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG3, Length 1,455 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3-208ENST00000495756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.02■■■■■ 4.96
ATG3-208ENST00000495756 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.59■■■■■ 4.09
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ATG3-208ENST00000495756 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
ATG3-208ENST00000495756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.18■■■■□ 3.7
ATG3-208ENST00000495756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.1■■■■□ 3.69
ATG3-208ENST00000495756 MYO15BQ96JP2 1530 aa38■■■■□ 3.67
ATG3-208ENST00000495756 NACADO15069 1562 aa38■■■■□ 3.67
ATG3-208ENST00000495756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.86■■■■□ 3.65
ATG3-208ENST00000495756 SCRIBQ14160 1630 aa37.11■■■■□ 3.53
ATG3-208ENST00000495756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.03■■■■□ 3.52
ATG3-208ENST00000495756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.81■■■■□ 3.48
ATG3-208ENST00000495756 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.72■■■■□ 3.47
ATG3-208ENST00000495756 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
ATG3-208ENST00000495756 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.78■■■■□ 3.32
ATG3-208ENST00000495756 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
ATG3-208ENST00000495756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
ATG3-208ENST00000495756 SMARCA4P51532 1647 aa35.56■■■■□ 3.28
ATG3-208ENST00000495756 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.49■■■■□ 3.27
ATG3-208ENST00000495756 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.36■■■■□ 3.25
ATG3-208ENST00000495756 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.35■■■■□ 3.25
ATG3-208ENST00000495756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
ATG3-208ENST00000495756 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.2■■■■□ 3.23
ATG3-208ENST00000495756 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.19■■■■□ 3.22
ATG3-208ENST00000495756 SMARCA2P51531 1590 aa35.17■■■■□ 3.22
ATG3-208ENST00000495756 WIZO95785 1651 aa35.15■■■■□ 3.22
ATG3-208ENST00000495756 NCAPD3P42695 1498 aa35.06■■■■□ 3.2
ATG3-208ENST00000495756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
ATG3-208ENST00000495756 HMGXB3Q12766 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
ATG3-208ENST00000495756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
ATG3-208ENST00000495756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
ATG3-208ENST00000495756 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.4■■■■□ 3.1
ATG3-208ENST00000495756 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.07■■■■□ 3.05
ATG3-208ENST00000495756 CFTRP13569 1480 aa34.03■■■■□ 3.04
ATG3-208ENST00000495756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.02■■■■□ 3.04
ATG3-208ENST00000495756 NESP48681 1621 aa34.01■■■■□ 3.04
ATG3-208ENST00000495756 PRDM2Q13029 1718 aa33.82■■■■□ 3
ATG3-208ENST00000495756 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.77■■■■□ 3
ATG3-208ENST00000495756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.68■■■□□ 2.98
ATG3-208ENST00000495756 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.62■■■□□ 2.97
ATG3-208ENST00000495756 ERCC6Q03468 1493 aa33.59■■■□□ 2.97
ATG3-208ENST00000495756 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.57■■■□□ 2.96
ATG3-208ENST00000495756 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.38■■■□□ 2.93
ATG3-208ENST00000495756 ABCC8Q09428 1581 aa33.37■■■□□ 2.93
ATG3-208ENST00000495756 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
ATG3-208ENST00000495756 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
ATG3-208ENST00000495756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
ATG3-208ENST00000495756 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.25■■■□□ 2.91
ATG3-208ENST00000495756 CUX1P39880 1505 aa33.25■■■□□ 2.91
ATG3-208ENST00000495756 WDR62O43379 1518 aa33.24■■■□□ 2.91
ATG3-208ENST00000495756 TOPBP1Q92547 1522 aa33.23■■■□□ 2.91
ATG3-208ENST00000495756 SYNJ1O43426 1573 aa33.19■■■□□ 2.9
ATG3-208ENST00000495756 TOP2BQ02880 1626 aa33.15■■■□□ 2.9
ATG3-208ENST00000495756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.14■■■□□ 2.9
ATG3-208ENST00000495756 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.07■■■□□ 2.88
ATG3-208ENST00000495756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.03■■■□□ 2.88
ATG3-208ENST00000495756 TRIM41Q8WV44 630 aa33.02■■■□□ 2.88
ATG3-208ENST00000495756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
ATG3-208ENST00000495756 CUX2O14529 1486 aa32.97■■■□□ 2.87
ATG3-208ENST00000495756 SOGA1O94964 1423 aa32.88■■■□□ 2.85
ATG3-208ENST00000495756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.85■■■□□ 2.85
ATG3-208ENST00000495756 IFT140Q96RY7 1462 aa32.83■■■□□ 2.85
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ATG3-208ENST00000495756 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.73■■■□□ 2.83
ATG3-208ENST00000495756 WDR97A6NE52 1622 aa32.71■■■□□ 2.83
ATG3-208ENST00000495756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ATG3-208ENST00000495756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ATG3-208ENST00000495756 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
ATG3-208ENST00000495756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.55■■■□□ 2.8
ATG3-208ENST00000495756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
ATG3-208ENST00000495756 KIF27Q86VH2 1401 aa32.55■■■□□ 2.8
ATG3-208ENST00000495756 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.51■■■□□ 2.79
ATG3-208ENST00000495756 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.49■■■□□ 2.79
ATG3-208ENST00000495756 GRIN2BQ13224 1484 aa32.4■■■□□ 2.78
ATG3-208ENST00000495756 PBRM1Q86U86 1689 aa32.39■■■□□ 2.78
ATG3-208ENST00000495756 EEA1Q15075 1411 aa32.38■■■□□ 2.77
ATG3-208ENST00000495756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.36■■■□□ 2.77
ATG3-208ENST00000495756 IGF1RP08069 1367 aa32.33■■■□□ 2.77
ATG3-208ENST00000495756 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
ATG3-208ENST00000495756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.26■■■□□ 2.76
ATG3-208ENST00000495756 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.26■■■□□ 2.75
ATG3-208ENST00000495756 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
ATG3-208ENST00000495756 CUL7Q14999 1698 aa32.2■■■□□ 2.75
ATG3-208ENST00000495756 ADAMTS12P58397 1594 aa32.18■■■□□ 2.74
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ATG3-208ENST00000495756 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.15■■■□□ 2.74
ATG3-208ENST00000495756 SYNJ2O15056 1496 aa32.11■■■□□ 2.73
ATG3-208ENST00000495756 PRXQ9BXM0 1461 aa32.11■■■□□ 2.73
ATG3-208ENST00000495756 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
ATG3-208ENST00000495756 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.03■■■□□ 2.72
ATG3-208ENST00000495756 FBLN2P98095 1184 aa32.03■■■□□ 2.72
ATG3-208ENST00000495756 KIF21BO75037 1637 aa32.01■■■□□ 2.72
ATG3-208ENST00000495756 CHD1O14646 1710 aa32■■■□□ 2.71
ATG3-208ENST00000495756 GRIN2AQ12879 1464 aa31.99■■■□□ 2.71
ATG3-208ENST00000495756 GOLGA3Q08378 1498 aa31.88■■■□□ 2.69
ATG3-208ENST00000495756 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.85■■■□□ 2.69
ATG3-208ENST00000495756 NUP160Q12769 1436 aa31.81■■■□□ 2.68
ATG3-208ENST00000495756 CEP170Q5SW79 1584 aa31.8■■■□□ 2.68
ATG3-208ENST00000495756 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.76■■■□□ 2.67
ATG3-208ENST00000495756 OSCARQ8IYS5 282 aa31.75■■■□□ 2.67
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