Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5O60239 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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