Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN8O00124 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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