Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLI1P08151 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI1P08151 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI1P08151 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms