RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529878.1

SCN4B-204, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SCN4B, Length 566 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-204ENST00000529878 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.56■■■■□ 3.76
SCN4B-204ENST00000529878 ABCC9O60706 1549 aa34.7■■■■□ 3.14
SCN4B-204ENST00000529878 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.37■■■■□ 3.09
SCN4B-204ENST00000529878 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.92■■■□□ 2.86
SCN4B-204ENST00000529878 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.91■■■□□ 2.86
SCN4B-204ENST00000529878 NACADO15069 1562 aa32.63■■■□□ 2.81
SCN4B-204ENST00000529878 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.55■■■□□ 2.8
SCN4B-204ENST00000529878 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
SCN4B-204ENST00000529878 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.1■■■□□ 2.73
SCN4B-204ENST00000529878 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
SCN4B-204ENST00000529878 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.03■■■□□ 2.72
SCN4B-204ENST00000529878 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.9■■■□□ 2.7
SCN4B-204ENST00000529878 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.85■■■□□ 2.69
SCN4B-204ENST00000529878 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.52■■■□□ 2.64
SCN4B-204ENST00000529878 SCRIBQ14160 1630 aa31.48■■■□□ 2.63
SCN4B-204ENST00000529878 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.33■■■□□ 2.61
SCN4B-204ENST00000529878 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.31■■■□□ 2.6
SCN4B-204ENST00000529878 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SCN4B-204ENST00000529878 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.54■■■□□ 2.48
SCN4B-204ENST00000529878 NCAPD3P42695 1498 aa30.19■■■□□ 2.42
SCN4B-204ENST00000529878 CUX2O14529 1486 aa30.07■■■□□ 2.4
SCN4B-204ENST00000529878 ERCC6Q03468 1493 aa30.01■■■□□ 2.4
SCN4B-204ENST00000529878 SMARCA4P51532 1647 aa30.01■■■□□ 2.39
SCN4B-204ENST00000529878 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.99■■■□□ 2.39
SCN4B-204ENST00000529878 SMARCA2P51531 1590 aa29.89■■■□□ 2.38
SCN4B-204ENST00000529878 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SCN4B-204ENST00000529878 HMGXB3Q12766 1538 aa29.82■■■□□ 2.36
SCN4B-204ENST00000529878 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
SCN4B-204ENST00000529878 NESP48681 1621 aa29.7■■■□□ 2.34
SCN4B-204ENST00000529878 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SCN4B-204ENST00000529878 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.64■■■□□ 2.34
SCN4B-204ENST00000529878 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.47■■■□□ 2.31
SCN4B-204ENST00000529878 WIZO95785 1651 aa29.45■■■□□ 2.31
SCN4B-204ENST00000529878 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.41■■■□□ 2.3
SCN4B-204ENST00000529878 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
SCN4B-204ENST00000529878 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SCN4B-204ENST00000529878 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.26■■■□□ 2.28
SCN4B-204ENST00000529878 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.23■■■□□ 2.27
SCN4B-204ENST00000529878 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.08■■■□□ 2.25
SCN4B-204ENST00000529878 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SCN4B-204ENST00000529878 TRIM41Q8WV44 630 aa29.01■■■□□ 2.23
SCN4B-204ENST00000529878 WDR62O43379 1518 aa28.99■■■□□ 2.23
SCN4B-204ENST00000529878 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.91■■■□□ 2.22
SCN4B-204ENST00000529878 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.86■■■□□ 2.21
SCN4B-204ENST00000529878 CFTRP13569 1480 aa28.82■■■□□ 2.2
SCN4B-204ENST00000529878 OSCARQ8IYS5 282 aa28.81■■■□□ 2.2
SCN4B-204ENST00000529878 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.74■■■□□ 2.19
SCN4B-204ENST00000529878 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SCN4B-204ENST00000529878 PRDM2Q13029 1718 aa28.57■■■□□ 2.16
SCN4B-204ENST00000529878 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SCN4B-204ENST00000529878 IFT140Q96RY7 1462 aa28.38■■■□□ 2.13
SCN4B-204ENST00000529878 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SCN4B-204ENST00000529878 ABCC8Q09428 1581 aa28.28■■■□□ 2.12
SCN4B-204ENST00000529878 TOPBP1Q92547 1522 aa28.26■■■□□ 2.11
SCN4B-204ENST00000529878 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.23■■■□□ 2.11
SCN4B-204ENST00000529878 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.23■■■□□ 2.11
SCN4B-204ENST00000529878 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.23■■■□□ 2.11
SCN4B-204ENST00000529878 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.16■■■□□ 2.1
SCN4B-204ENST00000529878 ARHGEF11O15085 1522 aa28.14■■■□□ 2.1
SCN4B-204ENST00000529878 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.11■■■□□ 2.09
SCN4B-204ENST00000529878 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
SCN4B-204ENST00000529878 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SCN4B-204ENST00000529878 FBLN2P98095 1184 aa28.03■■■□□ 2.08
SCN4B-204ENST00000529878 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SCN4B-204ENST00000529878 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SCN4B-204ENST00000529878 CUX1P39880 1505 aa27.94■■■□□ 2.06
SCN4B-204ENST00000529878 SOGA1O94964 1423 aa27.91■■■□□ 2.06
SCN4B-204ENST00000529878 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.9■■■□□ 2.06
SCN4B-204ENST00000529878 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SCN4B-204ENST00000529878 CHD1O14646 1710 aa27.89■■■□□ 2.06
SCN4B-204ENST00000529878 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.89■■■□□ 2.05
SCN4B-204ENST00000529878 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SCN4B-204ENST00000529878 ARAP1Q96P48 1450 aa27.83■■■□□ 2.04
SCN4B-204ENST00000529878 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SCN4B-204ENST00000529878 WDR97A6NE52 1622 aa27.73■■■□□ 2.03
SCN4B-204ENST00000529878 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.7■■■□□ 2.03
SCN4B-204ENST00000529878 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SCN4B-204ENST00000529878 GRIN2BQ13224 1484 aa27.66■■■□□ 2.02
SCN4B-204ENST00000529878 SYNJ1O43426 1573 aa27.64■■■□□ 2.01
SCN4B-204ENST00000529878 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.62■■■□□ 2.01
SCN4B-204ENST00000529878 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
SCN4B-204ENST00000529878 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.59■■■□□ 2.01
SCN4B-204ENST00000529878 SYNJ2O15056 1496 aa27.59■■■□□ 2.01
SCN4B-204ENST00000529878 TOP2BQ02880 1626 aa27.59■■■□□ 2.01
SCN4B-204ENST00000529878 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.55■■■□□ 2
SCN4B-204ENST00000529878 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.52■■■□□ 2
SCN4B-204ENST00000529878 PBRM1Q86U86 1689 aa27.52■■■□□ 2
SCN4B-204ENST00000529878 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.5■■□□□ 1.99
SCN4B-204ENST00000529878 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SCN4B-204ENST00000529878 ADAMTS12P58397 1594 aa27.27■■□□□ 1.96
SCN4B-204ENST00000529878 GRIN2AQ12879 1464 aa27.26■■□□□ 1.95
SCN4B-204ENST00000529878 NUP160Q12769 1436 aa27.2■■□□□ 1.94
SCN4B-204ENST00000529878 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.2■■□□□ 1.94
SCN4B-204ENST00000529878 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.17■■□□□ 1.94
SCN4B-204ENST00000529878 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.14■■□□□ 1.94
SCN4B-204ENST00000529878 CEP170Q5SW79 1584 aa27.14■■□□□ 1.93
SCN4B-204ENST00000529878 JPH4Q96JJ6 628 aa27.06■■□□□ 1.92
SCN4B-204ENST00000529878 KIF27Q86VH2 1401 aa27.05■■□□□ 1.92
SCN4B-204ENST00000529878 SHROOM2Q13796 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
SCN4B-204ENST00000529878 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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