Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms