Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ANXA7-204ENST00000463788 739 ntTSL 310.24□□□□□ -0.776e-16■□□□□ 9
PABPC4Q13310 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.041e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 UBE2Z-207ENST00000513342 4250 ntTSL 28.6□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 STK40-208ENST00000482458 900 ntTSL 331.14■■■□□ 2.583e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.73e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TECR-204ENST00000594545 735 ntTSL 325.21■■□□□ 1.632e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 STK40-205ENST00000460017 511 ntTSL 524.1■■□□□ 1.453e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 RNASEH1-202ENST00000436842 2120 ntTSL 223.81■■□□□ 1.43e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.393e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.363e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 LINC01006-208ENST00000624071 651 nt22.71■■□□□ 1.233e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.043e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.023e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.993e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 221.24■□□□□ 0.993e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 521.02■□□□□ 0.963e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SCYL1-204ENST00000524897 820 ntTSL 220.7■□□□□ 0.93e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRR14-206ENST00000564946 2117 ntTSL 220.38■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SCYL1-212ENST00000531601 896 ntTSL 320■□□□□ 0.793e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 419.93■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 519.74■□□□□ 0.753e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.753e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRR14-201ENST00000287463 2124 ntTSL 219.67■□□□□ 0.743e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 519.66■□□□□ 0.743e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRR14-208ENST00000565977 603 ntTSL 219.62■□□□□ 0.733e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.713e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-235ENST00000497943 2824 ntTSL 219.24■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRMT1-210ENST00000528126 642 ntTSL 218.87■□□□□ 0.613e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.613e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 218.6■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 AIP-203ENST00000528641 815 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 217.78■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ESRRB-206ENST00000512784 1826 ntTSL 517.77■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.433e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MIIP-206ENST00000492256 806 ntTSL 217.61■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ATG9A-220ENST00000475339 812 ntTSL 217.59■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 217.17■□□□□ 0.342e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 SCYL1-211ENST00000529981 497 ntTSL 316.76■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 216.09■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-219ENST00000491128 2570 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PDLIM7-212ENST00000504380 556 ntTSL 215.5■□□□□ 0.073e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SDCCAG3-205ENST00000417512 626 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 USP5-204ENST00000537267 2522 ntTSL 515.24■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -03e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TAP2-203ENST00000464100 849 ntTSL 214.77□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.092e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMYD5-207ENST00000486518 566 ntTSL 214.15□□□□□ -0.143e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SDCCAG3-207ENST00000461693 869 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ESRRB-202ENST00000505752 2432 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TECR-224ENST00000601461 828 ntTSL 313.43□□□□□ -0.262e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.283e-6■□□□□ 9
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