Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms