Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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