Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms