RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253332.5

AKAP12-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 12, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP12, Length 6,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP12-201ENST00000253332 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.83■■■□□ 2.05
AKAP12-201ENST00000253332 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.92■■□□□ 1.74
AKAP12-201ENST00000253332 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
AKAP12-201ENST00000253332 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.16■■□□□ 1.62
AKAP12-201ENST00000253332 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
AKAP12-201ENST00000253332 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
AKAP12-201ENST00000253332 APLP2Q06481 763 aa24.58■■□□□ 1.53
AKAP12-201ENST00000253332 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
AKAP12-201ENST00000253332 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AKAP12-201ENST00000253332 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
AKAP12-201ENST00000253332 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.89■■□□□ 1.42
AKAP12-201ENST00000253332 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.83■■□□□ 1.41
AKAP12-201ENST00000253332 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.81■■□□□ 1.4
AKAP12-201ENST00000253332 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.75■■□□□ 1.39
AKAP12-201ENST00000253332 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.57■■□□□ 1.36
AKAP12-201ENST00000253332 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AKAP12-201ENST00000253332 MYT1Q01538 1121 aa23.5■■□□□ 1.35
AKAP12-201ENST00000253332 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AKAP12-201ENST00000253332 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AKAP12-201ENST00000253332 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
AKAP12-201ENST00000253332 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.45■■□□□ 1.34
AKAP12-201ENST00000253332 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
AKAP12-201ENST00000253332 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
AKAP12-201ENST00000253332 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AKAP12-201ENST00000253332 TRIM41Q8WV44 630 aa23.36■■□□□ 1.33
AKAP12-201ENST00000253332 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
AKAP12-201ENST00000253332 ITGAEP38570 1179 aa23.24■■□□□ 1.31
AKAP12-201ENST00000253332 NEFLP07196 543 aa23.04■■□□□ 1.28
AKAP12-201ENST00000253332 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
AKAP12-201ENST00000253332 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
AKAP12-201ENST00000253332 SLC24A1O60721 1099 aa22.66■■□□□ 1.22
AKAP12-201ENST00000253332 BCL11AQ9H165 835 aa22.65■■□□□ 1.22
AKAP12-201ENST00000253332 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.61■■□□□ 1.21
AKAP12-201ENST00000253332 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
AKAP12-201ENST00000253332 BCANQ96GW7 911 aa22.52■■□□□ 1.19
AKAP12-201ENST00000253332 FBLN2P98095 1184 aa22.51■■□□□ 1.19
AKAP12-201ENST00000253332 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.45■■□□□ 1.18
AKAP12-201ENST00000253332 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
AKAP12-201ENST00000253332 TRIM52Q96A61 297 aa22.34■■□□□ 1.17
AKAP12-201ENST00000253332 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
AKAP12-201ENST00000253332 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
AKAP12-201ENST00000253332 ARID3CA6NKF2 412 aa22.29■■□□□ 1.16
AKAP12-201ENST00000253332 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
AKAP12-201ENST00000253332 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.21■■□□□ 1.15
AKAP12-201ENST00000253332 NEUROD1Q13562 356 aa22.18■■□□□ 1.14
AKAP12-201ENST00000253332 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
AKAP12-201ENST00000253332 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
AKAP12-201ENST00000253332 PLEKHG5O94827 1062 aa21.93■■□□□ 1.1
AKAP12-201ENST00000253332 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
AKAP12-201ENST00000253332 A0A0G2JS52 829 aa21.91■■□□□ 1.1
AKAP12-201ENST00000253332 P3H3Q8IVL6 736 aa21.91■■□□□ 1.1
AKAP12-201ENST00000253332 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
AKAP12-201ENST00000253332 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
AKAP12-201ENST00000253332 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
AKAP12-201ENST00000253332 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
AKAP12-201ENST00000253332 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
AKAP12-201ENST00000253332 ABCC9O60706 1549 aa21.83■■□□□ 1.09
AKAP12-201ENST00000253332 HRCP23327 699 aa21.83■■□□□ 1.08
AKAP12-201ENST00000253332 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
AKAP12-201ENST00000253332 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.79■■□□□ 1.08
AKAP12-201ENST00000253332 NEFMP07197 916 aa21.73■■□□□ 1.07
AKAP12-201ENST00000253332 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.64■■□□□ 1.05
AKAP12-201ENST00000253332 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
AKAP12-201ENST00000253332 ANP32CO43423 234 aa21.49■■□□□ 1.03
AKAP12-201ENST00000253332 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
AKAP12-201ENST00000253332 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
AKAP12-201ENST00000253332 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AKAP12-201ENST00000253332 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.025e-7■■■□□ 18.2
AKAP12-201ENST00000253332 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
AKAP12-201ENST00000253332 C14orf37Q86TY3 774 aa21.4■■□□□ 1.02
AKAP12-201ENST00000253332 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
AKAP12-201ENST00000253332 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
AKAP12-201ENST00000253332 ARXQ96QS3 562 aa21.26■□□□□ 0.99
AKAP12-201ENST00000253332 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
AKAP12-201ENST00000253332 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
AKAP12-201ENST00000253332 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.18■□□□□ 0.98
AKAP12-201ENST00000253332 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.17■□□□□ 0.98
AKAP12-201ENST00000253332 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
AKAP12-201ENST00000253332 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.14■□□□□ 0.97
AKAP12-201ENST00000253332 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.13■□□□□ 0.97
AKAP12-201ENST00000253332 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.07■□□□□ 0.96
AKAP12-201ENST00000253332 KCNH8Q96L42 1107 aa21.06■□□□□ 0.96
AKAP12-201ENST00000253332 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
AKAP12-201ENST00000253332 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.02■□□□□ 0.96
AKAP12-201ENST00000253332 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.01■□□□□ 0.95
AKAP12-201ENST00000253332 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.98■□□□□ 0.95
AKAP12-201ENST00000253332 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
AKAP12-201ENST00000253332 NPHP1O15259 732 aa20.95■□□□□ 0.94
AKAP12-201ENST00000253332 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
AKAP12-201ENST00000253332 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.95■□□□□ 0.94
AKAP12-201ENST00000253332 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
AKAP12-201ENST00000253332 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
AKAP12-201ENST00000253332 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
AKAP12-201ENST00000253332 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
AKAP12-201ENST00000253332 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
AKAP12-201ENST00000253332 TMC1Q8TDI8 760 aa20.86■□□□□ 0.93
AKAP12-201ENST00000253332 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
AKAP12-201ENST00000253332 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
AKAP12-201ENST00000253332 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
AKAP12-201ENST00000253332 TONSLQ96HA7 1378 aa20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms