RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.11■■■■□ 3.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
USP3-AS1-204ENST00000559861 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31■■■□□ 2.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXD1Q16676 465 aa30.57■■■□□ 2.48
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.53■■■□□ 2.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADRA2BP18089 450 aa29.5■■■□□ 2.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSH5O43196 834 aa28.14■■■□□ 2.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.32■■□□□ 1.96
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNA4P22459 653 aa26.86■■□□□ 1.89
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.54■■□□□ 1.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.35■■□□□ 1.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.56■■□□□ 1.68
USP3-AS1-204ENST00000559861 POTEDQ86YR6 584 aa25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.12■■□□□ 1.61
USP3-AS1-204ENST00000559861 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.98■■□□□ 1.59
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC4A2P04920 1241 aa24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB22O15209 634 aa24.72■■□□□ 1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.68■■□□□ 1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-204ENST00000559861 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF39Q9H2S5 420 aa24.13■■□□□ 1.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATXN8OSP0DMR3 200 aa23.83■■□□□ 1.41
USP3-AS1-204ENST00000559861 APLP2Q06481 763 aa23.7■■□□□ 1.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAPN15O75808 1086 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-204ENST00000559861 DSG3P32926 999 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLA2Q14181 598 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCB7O75027 752 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBLN2P98095 1184 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 FKBP8Q14318 412 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSCARQ8IYS5 282 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE6P0CI01 402 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-204ENST00000559861 PROM2Q8N271 834 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKT1S1Q96B36 256 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO3Q9UK99 471 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-204ENST00000559861 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-204ENST00000559861 PITPNM1O00562 1244 aa21.21■□□□□ 0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.21■□□□□ 0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR29P0C7W0 189 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIER1Q8N108 512 aa20.96■□□□□ 0.95
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-204ENST00000559861 CREBZFQ9NS37 354 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLEKHG5O94827 1062 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHL34Q8N239 644 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHADLQ6NUI6 762 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-204ENST00000559861 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPOCK2Q92563 424 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUBP1P53384 320 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RASEFQ8IZ41 740 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKD2Q13563 968 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM212AQ96EL1 285 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 GSE1Q14687 1217 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 POTEHQ6S545 545 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM41Q8WV44 630 aa20.1■□□□□ 0.81
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