Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms