Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms