Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCOLCE2Q9UKZ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCOLCE2Q9UKZ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCE2Q9UKZ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms